C9Z790-CGW este o placa de baza in format ATX (30.5 x 24.4 cm), care ofera 2 sloturi x16 PCIe Gen 5 care pot functiona in mod x16 / – sau x8 / x8, precum si 2 sloturi x1 PCIe Gen 3 conectate direct la PCH. In ceea ce priveste porturile M.2 avem unul x4 PCIe Gen 4 conectat la procesor si 2 porturi  M.2 x4 PCIe 3. Al 4-lea slot M.2 este Type-E, dedicat placii de retea Wi-Fi / BT, care este inclusa in pachet. Pentru cei care inca mai folosesc HDD sau SSD SATA,Supermicro C9Z790-CGW are 6 astfel de porturi.

Supermicro C9Z790-CGW este dotata cu debug LED, dar si cu butoane on-board de Power, Reset si Clear CMOS. Conectarea la retea este asigurata de un chip Intel I219-V 1G impreuna cu un chip Marvell AQC113 (10G), in timp ce suportul WiFi este asigurat de o placa Intel AX211 NGW care suporta WiFi 6E si Bluetooth 5.3.

Ca si conectivitate interna, Supermicro C9Z790-CGW are 1 conector cu 2 porturi USB 3.2 Gen 1, 1 conector USB 2.0 ce pot suporta un maxim de 2 porturi si un conector Type-E pentru USB Type-C (USB 3.2 Gen 2 x2). La capitolul audio intalnim o solutie mainstream, probabil pentru a mai salva ceva la pret, bazata pe un Realtek ALC1220 si capacitori electrolitici.